Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GCATO75600 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GCATO75600 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GCATO75600 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GCATO75600 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GCATO75600 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GCATO75600 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms