Protein–RNA interactions for Protein: O75446

SAP30, Histone deacetylase complex subunit SAP30, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAP30O75446 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAP30O75446 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAP30O75446 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAP30O75446 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAP30O75446 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAP30O75446 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAP30O75446 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAP30O75446 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAP30O75446 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SAP30O75446 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SAP30O75446 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SAP30O75446 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SAP30O75446 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SAP30O75446 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAP30O75446 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAP30O75446 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAP30O75446 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAP30O75446 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SAP30O75446 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms