Protein–RNA interactions for Protein: O75419

CDC45, Cell division control protein 45 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC45O75419 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC45O75419 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC45O75419 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC45O75419 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC45O75419 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC45O75419 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC45O75419 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC45O75419 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC45O75419 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CDC45O75419 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CDC45O75419 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC45O75419 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC45O75419 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC45O75419 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC45O75419 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC45O75419 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC45O75419 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC45O75419 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC45O75419 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC45O75419 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC45O75419 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CDC45O75419 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC45O75419 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC45O75419 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC45O75419 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC45O75419 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC45O75419 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC45O75419 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC45O75419 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC45O75419 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC45O75419 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC45O75419 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC45O75419 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC45O75419 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CDC45O75419 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC45O75419 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC45O75419 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC45O75419 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC45O75419 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC45O75419 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC45O75419 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC45O75419 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC45O75419 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC45O75419 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC45O75419 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC45O75419 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC45O75419 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC45O75419 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC45O75419 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC45O75419 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC45O75419 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC45O75419 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC45O75419 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC45O75419 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC45O75419 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC45O75419 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC45O75419 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC45O75419 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC45O75419 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC45O75419 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC45O75419 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC45O75419 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC45O75419 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC45O75419 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC45O75419 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC45O75419 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC45O75419 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC45O75419 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms