Protein–RNA interactions for Protein: O60682

MSC, Musculin, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSCO60682 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSCO60682 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSCO60682 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSCO60682 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
MSCO60682 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSCO60682 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
MSCO60682 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSCO60682 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSCO60682 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSCO60682 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSCO60682 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
MSCO60682 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSCO60682 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSCO60682 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSCO60682 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSCO60682 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSCO60682 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSCO60682 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
MSCO60682 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSCO60682 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSCO60682 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSCO60682 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSCO60682 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSCO60682 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
MSCO60682 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
MSCO60682 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
MSCO60682 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
MSCO60682 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSCO60682 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSCO60682 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSCO60682 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSCO60682 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MSCO60682 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MSCO60682 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MSCO60682 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSCO60682 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSCO60682 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MSCO60682 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MSCO60682 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSCO60682 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms