Protein–RNA interactions for Protein: O60524

NEMF, Nuclear export mediator factor NEMF, humanhuman

Predictions only

Length 1,076 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEMFO60524 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NEMFO60524 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NEMFO60524 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NEMFO60524 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEMFO60524 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
NEMFO60524 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NEMFO60524 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NEMFO60524 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMFO60524 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMFO60524 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMFO60524 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMFO60524 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMFO60524 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMFO60524 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMFO60524 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMFO60524 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMFO60524 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMFO60524 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NEMFO60524 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms