Protein–RNA interactions for Protein: O43924

PDE6D, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit delta, humanhuman

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Length 150 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6DO43924 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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PDE6DO43924 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDE6DO43924 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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