Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SYNGR3O43761 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms