Protein–RNA interactions for Protein: O43610

SPRY3, Protein sprouty homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRY3O43610 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SPRY3O43610 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SPRY3O43610 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms