Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DENRO43583 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DENRO43583 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DENRO43583 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
DENRO43583 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DENRO43583 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DENRO43583 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DENRO43583 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
DENRO43583 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
DENRO43583 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
DENRO43583 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
DENRO43583 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DENRO43583 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DENRO43583 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DENRO43583 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DENRO43583 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
DENRO43583 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
DENRO43583 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DENRO43583 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DENRO43583 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DENRO43583 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
DENRO43583 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
DENRO43583 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
DENRO43583 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
DENRO43583 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
DENRO43583 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
DENRO43583 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms