Protein–RNA interactions for Protein: O43526

KCNQ2, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 2, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ2O43526 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
KCNQ2O43526 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
KCNQ2O43526 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms