Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

Predictions only

Length 872 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KCNQ3O43525 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KCNQ3O43525 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms