Protein–RNA interactions for Protein: O43439

CBFA2T2, Protein CBFA2T2, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFA2T2O43439 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CBFA2T2O43439 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CBFA2T2O43439 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms