Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRPF3O43395 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PRPF3O43395 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PRPF3O43395 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms