Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HOXA2O43364 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HOXA2O43364 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms