Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATMINO43313 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATMINO43313 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATMINO43313 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMINO43313 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMINO43313 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMINO43313 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMINO43313 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMINO43313 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMINO43313 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMINO43313 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMINO43313 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMINO43313 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMINO43313 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATMINO43313 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMINO43313 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMINO43313 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMINO43313 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMINO43313 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMINO43313 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMINO43313 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMINO43313 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMINO43313 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMINO43313 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMINO43313 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMINO43313 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATMINO43313 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMINO43313 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMINO43313 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMINO43313 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMINO43313 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMINO43313 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMINO43313 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMINO43313 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMINO43313 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMINO43313 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMINO43313 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATMINO43313 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATMINO43313 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATMINO43313 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATMINO43313 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
ATMINO43313 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATMINO43313 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms