Protein–RNA interactions for Protein: O43237

DYNC1LI2, Cytoplasmic dynein 1 light intermediate chain 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYNC1LI2O43237 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
DYNC1LI2O43237 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
DYNC1LI2O43237 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms