Protein–RNA interactions for Protein: O15335

CHAD, Chondroadherin, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHADO15335 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHADO15335 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHADO15335 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHADO15335 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CHADO15335 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHADO15335 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHADO15335 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHADO15335 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHADO15335 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHADO15335 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHADO15335 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHADO15335 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CHADO15335 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CHADO15335 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHADO15335 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHADO15335 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHADO15335 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHADO15335 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHADO15335 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHADO15335 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHADO15335 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHADO15335 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHADO15335 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHADO15335 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHADO15335 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHADO15335 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHADO15335 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHADO15335 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHADO15335 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHADO15335 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHADO15335 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHADO15335 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHADO15335 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHADO15335 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHADO15335 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHADO15335 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHADO15335 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHADO15335 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHADO15335 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHADO15335 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHADO15335 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHADO15335 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHADO15335 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHADO15335 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHADO15335 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHADO15335 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms