Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
POLR1CO15160 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
POLR1CO15160 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms