Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
IFIT3O14879 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
IFIT3O14879 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms