Protein–RNA interactions for Protein: O00451

GFRA2, GDNF family receptor alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA2O00451 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GFRA2O00451 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GFRA2O00451 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms