Protein–RNA interactions for Protein: O00295

TULP2, Tubby-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TULP2O00295 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP2O00295 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP2O00295 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP2O00295 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP2O00295 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP2O00295 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP2O00295 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP2O00295 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP2O00295 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP2O00295 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TULP2O00295 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TULP2O00295 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TULP2O00295 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TULP2O00295 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TULP2O00295 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TULP2O00295 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TULP2O00295 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP2O00295 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP2O00295 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP2O00295 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP2O00295 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TULP2O00295 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms