Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
J3KR12 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
J3KR12 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
J3KR12 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
J3KR12 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
J3KR12 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
J3KR12 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
J3KR12 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3KR12 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
J3KR12 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3KR12 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3KR12 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
J3KR12 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
J3KR12 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
J3KR12 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
J3KR12 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
J3KR12 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
J3KR12 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
J3KR12 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
J3KR12 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
J3KR12 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
J3KR12 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms