Protein–RNA interactions for Protein: I3L4J1

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
I3L4J1 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
I3L4J1 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
I3L4J1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
I3L4J1 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
I3L4J1 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
I3L4J1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
I3L4J1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
I3L4J1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
I3L4J1 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
I3L4J1 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
I3L4J1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
I3L4J1 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
I3L4J1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
I3L4J1 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
I3L4J1 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
I3L4J1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
I3L4J1 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
I3L4J1 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
I3L4J1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
I3L4J1 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
I3L4J1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
I3L4J1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
I3L4J1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
I3L4J1 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
I3L4J1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
I3L4J1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
I3L4J1 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
I3L4J1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
I3L4J1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
I3L4J1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
I3L4J1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
I3L4J1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
I3L4J1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
I3L4J1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
I3L4J1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
I3L4J1 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
I3L4J1 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
I3L4J1 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
I3L4J1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
I3L4J1 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
I3L4J1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
I3L4J1 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms