Protein–RNA interactions for Protein: H7C241

CLDN34, Claudin-34, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN34H7C241 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CLDN34H7C241 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CLDN34H7C241 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms