Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.02□□□□□ -0.01
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