Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ERVV-2B6SEH9 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ERVV-2B6SEH9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms