Protein–RNA interactions for Protein: A6NHT5

HMX3, Homeobox protein HMX3, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX3A6NHT5 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMX3A6NHT5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HMX3A6NHT5 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.9 ms