Protein–RNA interactions for Protein: A3QJZ6

PRAMEF22, PRAME family member 22, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF22A3QJZ6 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PRAMEF22A3QJZ6 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRAMEF22A3QJZ6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms