Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RQF3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RQF3 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
A0A0U1RQF3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
A0A0U1RQF3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms