Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
SLC4A4Q9Y6R1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SLC4A4Q9Y6R1 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms