Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y620

RAD54B, DNA repair and recombination protein RAD54B, humanhuman

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54BQ9Y620 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAD54BQ9Y620 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAD54BQ9Y620 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms