Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
KIF3AQ9Y496 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
KIF3AQ9Y496 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms