Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

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Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
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HCN4Q9Y3Q4 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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HCN4Q9Y3Q4 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
HCN4Q9Y3Q4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
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HCN4Q9Y3Q4 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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HCN4Q9Y3Q4 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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HCN4Q9Y3Q4 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
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HCN4Q9Y3Q4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
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HCN4Q9Y3Q4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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HCN4Q9Y3Q4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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HCN4Q9Y3Q4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
HCN4Q9Y3Q4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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