Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3P4

RHBDD3, Rhomboid domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RHBDD3Q9Y3P4 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RHBDD3Q9Y3P4 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms