Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PRG3Q9Y2Y8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PRG3Q9Y2Y8 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms