Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NUDCQ9Y266 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NUDCQ9Y266 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms