Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU9

SAMD4A, Protein Smaug homolog 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD4AQ9UPU9 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD4AQ9UPU9 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD4AQ9UPU9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMD4AQ9UPU9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMD4AQ9UPU9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMD4AQ9UPU9 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SAMD4AQ9UPU9 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms