Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ3

AGAP1, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1Q9UPQ3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
AGAP1Q9UPQ3 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
AGAP1Q9UPQ3 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms