Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNRF3Q9ULT6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNRF3Q9ULT6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms