Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF3Q9ULD4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF3Q9ULD4 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF3Q9ULD4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF3Q9ULD4 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF3Q9ULD4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF3Q9ULD4 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF3Q9ULD4 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF3Q9ULD4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF3Q9ULD4 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
BRPF3Q9ULD4 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
BRPF3Q9ULD4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms