Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB1

FBXW11, F-box/WD repeat-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXW11Q9UKB1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
FBXW11Q9UKB1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
FBXW11Q9UKB1 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms