Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GGA2Q9UJY4 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms