Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDC23Q9UJX2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDC23Q9UJX2 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms