Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CDH22Q9UJ99 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CDH22Q9UJ99 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms