Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
RABGEF1Q9UJ41 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
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RABGEF1Q9UJ41 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
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RABGEF1Q9UJ41 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RABGEF1Q9UJ41 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RABGEF1Q9UJ41 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RABGEF1Q9UJ41 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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RABGEF1Q9UJ41 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
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RABGEF1Q9UJ41 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
RABGEF1Q9UJ41 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
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