Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU0

TCF20, Transcription factor 20, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF20Q9UGU0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TCF20Q9UGU0 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC22■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TCF20Q9UGU0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms