Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ABCF2Q9UG63 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ABCF2Q9UG63 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms