Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
IFT172Q9UG01 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC29.85■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
IFT172Q9UG01 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms