Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFD9

RIMBP3, RIMS-binding protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 1,639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMBP3Q9UFD9 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC33.95■■■■□ 3.03
RIMBP3Q9UFD9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC33.92■■■■□ 3.02
RIMBP3Q9UFD9 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms