Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
APEX2Q9UBZ4 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
APEX2Q9UBZ4 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms